Seminare

Proteomics - Anwendungen und Methoden

Seminar - Dr. Klinkner & Partner GmbH

Es werden komplette Workflows zum Umgang mit Proteomics in den Vordergrund gestellt. Diese beginnen bei der Probenauswahl und deren Vorbereitung, gehen über die Analyse mittels Massenspektrometrie, bis hin zur Verarbeitung der erhaltenen Daten sowie deren Interpretation und den Umsatz in schlüssige Informationen. Alle Aspekte der hochmodernen Proteomic werden beleuchtet und präsentiert. Zudem werden Fallstricke aufgezeigt sowie die Fehlerbehebung in komplexen Workflows angesprochen und diskutiert.
Termin Ort Preis*
19.11.2019- 20.11.2019 Heidelberg 1.057,91 €
*Alle Preise verstehen sich inkl. MwSt.

Detaillierte Informationen zum Seminar

Inhalte:

Tag 1: 19.11.2019 | Grundlagen und Probenvorbereitung | Dr. Raida

Definition und Ziele von Proteomics

  • Einführung und kurze Historie des Verfahrens
  • Beispiele der Proteomics-Forschung in Industrie, klinischen Verfahren und der Grundlagenforschung


Die Definition der Proteinstruktur

Aufbau eines Proteins

  • Aminosäuren-Sequenz, Posttranslationale Modifikationen, Struktur, Interaktionen

Von der Sequenz-Information über Interaktion bis hin zur biologischen Funktion

Die Komplexität des Proteoms


Applikationsfelder des Proteomic-Verfahrens

  • Aufzeigung des Nutzens anhand von Beispielen aus dem Bereich der Industrie, medizinischen Laboren sowie der Grundlagenforschung


Probenherstellung für Proteom-Analysen

  • Gestaltung aussagekräftiger Studien in verschiedenen Anwendungsbereichen


Probenvorbereitung für Proteom-Analysen

Chromatografische Trennmethoden

  • Methodenentwicklung zur Peptidtrennung für LC-MS und LC-MS/MS

Elektrophoretische Trennmethoden

  • Eindimensionale und zweidimensionale Gelelektrophorese

Affinitäts- und Anreicherungstechniken

In-solution und In-gel-Verdau von Proteinen

  • Verwendung verschiedener Enzyme
  • Chemische Spaltung
  • Spezielle Methoden (Filter aided sample preparation - FASP)

Spezifische Anreicherungsansätze

  • Phosphopeptide
  • Glykosylierung
  • Verwendung von Antikörpern zur Anreicherung

Peptid-Trennung

  • HILIC
  • ERLIC
  • high-pH reversed phase HPLC
  • TIO2Phosphopeptid-Anreicherung

Protein-Protein-Interaktionen

Molekül-Protein-Interaktionen

  • Chemical Proteomics

Peptidomics - ein Teilgebiet von Proteomics


Tag 2: 20.11.2019 | Probenmessung und Ergebnisinterpretation | Dr. Raida

Probenanalyse

Massenspektrometrie

  • Grundlagen der Massenspektrometrie und Ionisierung (Maldi, Elektrospray)

Geräte der Massenspektrometrie

  • Triple Quad, Time-of-Flight, Ionenfallen, Orbitraps und darüber hinaus
  • Fragmentierung

Kopplung von Flüssigkeitschromatografie mit Massenspektrometrie

  • Analyse komplexer Proben

Methodenentwicklung zur massenspektrometrischen Proteom-Analyse

  • Datenabhängige Methoden
  • Bottom-up Proteomics
  • Datenunabhängige Methoden (SWATH)
  • Gezielte Methoden (MRM/SRM)

Optimierungen der Geräteeinstellungen sowie der Trennverfahren

  • Fallstricke
  • Troubleshooting

Blick auf künftige Entwicklungen

  • Top-down Proteomics
  • Middle-up Proteomics


Interpretation von Rohdaten

  • Grundlegendes Verständnis erhaltener Rohdaten
  • Weiterverarbeitung von Rohdaten


Datenbank-Analysen

  • Datenbank-Suche sinnvoll bewerkstelligen
  • Verfügbare Datenbanken
  • Verfügbare Software zur Datenbank-Suche
  • Fallstricke und Troubleshooting


Ergebnisse interpretieren und in Informationen umwandeln

  • System Biologie - der nächste Schritt


    Weitere -omics

    • Lipidomics
    • Transcriptomics
    • Metabolomics


    Dauer/zeitlicher Ablauf:
    Tag 1: 10:00-17:00, Tag 2: 09:00-16:00
    Zielgruppe:
    Das Seminar richtet sich an Anwender, welche in den Bereichen der Pharmaindustrie, der Lebensmittel- und Getränkeindustrie, der Forschung und Entwicklung sowie medizinischer und diagnostischer Labore tätig sind und einen Einblick in das Themengebiet Proteomics erlangen, beziehungsweise bestehende Kenntnisse vertiefen möchten. Weiterhin werden Teilnehmer aus den Gebieten der Biotechnologie, der Biomaterialforschung sowie der synthetischen Biologie angesprochen.
    Seminarkennung:
    SPRT-1
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